2021年のMotoGP 第3戦 ポルトガルGPが4月16日（金）にアウトードロモ・インテルナシオナル・ド・アルガルヴェで行われ、フランチェスコ・バグナイア（Ducati Lenovo Team）がトップタイムをマークした。フランチェスコ・バグナイアは、唯一1分40秒台を突破。開幕戦カタールGPの公式予選2以来今季2度目のトップタイム、MotoGPクラス3年目で初めて初日総合1番手に進出した。
2番手タイムはファビオ・クラルタラロ（Monster Energy Yamaha MotoGP）、3番手にはジョアン・ミル（Team SUZUKI ECSTAR）。また、今大会で復帰を果たしたマルク・マルケス（Repsol Honda Team）は6番手タイムで初日のセッションを終えた。 順位ライダーチームマシンタイム 1 F・バニャイア Ducati Lenovo TeamDucati 1'39.866 2 F・クアルタラロ Monster Energy Yamaha MotoGPYamaha 1'40.206 3 J・ミルTeam SUZUKI ECSTARSuzuki 1'40.285 4 A・リンスTeam SUZUKI ECSTARSuzuki 1'40.328 5 J・ミラー Ducati Lenovo TeamDucati 1'40.336 6 M・マルケスRepsol Honda TeamHonda 1'40.339 7 M・ビニャーレス Monster Energy Yamaha MotoGPYamaha 1'40.426 8 J・ザルコ Pramac RacingDucati 1'40.490 9 M・オリベイラ Red Bull KTM Factory RacingKTM 1'40.592 10 中上貴晶 LCR Honda IDEMITSUHonda 1'40.611 11 A・マルケス LCR Honda CASTROLHonda1'40.732 12 P・エスパルガロ Repsol Honda TeamHonda 1'40.743 13 L・マリーニ SKY VR46 EsponsoramaDucati 1'40.761 14 A・エスパルガロ Aprilia Racing Team GresiniAprilia 1'40.907 15 V・ロッシ Petronas Yamaha SRTYamaha 1'41.125 16 L・サバドーリ Aprilia Racing Team Gresini Aprilia 1'41.140 17 B・ビンダーRed Bull KTM Factory RacingKTM 1'41.183 18 D・ペトルッチ Tech 3 KTM Factory RacingKTM 1'41.187 19 F・モルビデリ Petronas Yamaha SRTYamaha 1'41.216 20 E・バスティアニーニ Esponsorama RacingDucati 1'41.836 21 I・レクオーナ Tech 3 KTM Factory RacingKTM 1'42.461 22 J・マルティン Pramac RacingDucati 1'42.921