2021年 MotoGP 第14戦サンマリノGPの公式予選が9月18日(土)にミサノ・ワールド・サーキット・マルコ・シモンチェリで行われ、フランチェスコ・バグナイア(Ducati Lenovo Team)が2戦連続となるポールポジションを獲得した。気温28度、路面温度37度のドライコンディションの中、フリー走行総合1位のフランチェスコ・バグナイアが週末2度目、今季10度目のトップタイムをマーク。プレミアクラスで初優勝を挙げた前戦アラゴンGPに続き2戦連続3度目のポールポジションを奪取した。
ドゥカティ4台がトップ5に進出フリー走行総合3位のジャック・ミラーは0.249秒差の2番手。2戦連続の2番グリッドを獲得し、ドゥカティ・レノボ・チームが2戦連続のトップ2に進出。フリー走行総合10位のホルヘ・マルティンは0.598秒差の4番手。フリー走行総合8位のヨハン・ザルコは0.771秒差の5番手。フリー走行総合19位のエネア・バスティアニーニは、公式予選1を1番手で通過した後、今季2度目の公式予選2で12番手。クアルタラロ12戦連続の1列目レースシミュレーションのフリー走行4で最速ペースを刻んで1番手に進出したフリー走行総合2位のファビオ・クアルタラロは1コーナーで今季4度目の転倒を喫したが、0.302秒差の3番手に入り、12戦連続13度目の1列目を確保。年間の予選最速を決定する『BMW M Award』のタイトル連覇に王手をかけた。リンス9番手/ミル11番手フリー走行総合7位のアレックス・リンスは0.952秒差の9番手。フリー走行総合4位のジョアン・ミルは1.361秒差の11番手。アプリリアが30戦ぶりに2人が公式予選2に進出2019年10月の第17戦オーストラリアGP以来30戦ぶりに2人が揃って公式予選2に進出すると、フリー走行総合6位のアレイシ・エスパルガロは15コーナーで今季10度目の転倒を喫して0.872秒差の8番手。フリー走行総合5位のマーベリック・ビニャーレスは1.056秒差の10番手。アプリリアのデビュー戦となった7列目19番グリッドを大きく上回り、4列目に進出。マルケス兄転倒7番手フリー走行総合9位のポル・エスパルガロは0.858秒差の6番手。ホンダ勢の最高位に進出すれば、フリー走行総合14位のマルク・マルケスは9コーナーで週末2度目、今季20度目の転倒を喫して0.870秒差の7番手。公式予選1フリー走行総合12位の中上貴晶は、今季7度目の公式予選1で7ラップ目の9コーナーで今季7度目の転倒を喫して0.334秒差の3番手。フリー走行総合15位のフランコ・モルビデリは5番手。フリー走行総合18位のバレンティーノ・ロッシは15コーナーで週末2度目、今季8度目の転倒を喫して13番手。フリー走行総合23位のブラッド・ビンダーは、2コーナーで今季5度目の転倒を喫してKTM勢の最高位となる7番手。フリー走行総合20位のアンドレア・ドビツィオーゾは14番手だった。順位ライダーチームマシンタイム1 F・バニャイア Ducati Lenovo TeamDucati1'31.0652J・ミラー Ducati Lenovo TeamDucati1'31.3143 F・クアルタラロ Monster Energy Yamaha MotoGPYamaha1'31.3674 J・マルティン Pramac RacingDucati1'31.6635 J・ザルコ Pramac RacingDucati1'31.8366 P・エスパルガロ Repsol Honda TeamHonda1'31.9237 M・マルケスRepsol Honda TeamHonda1'31.9358 A・エスパルガロ Aprilia Racing Team GresiniAprilia1'31.9379 A・リンスTeam SUZUKI ECSTARSuzuki1'32.01710M・ビニャーレス Aprilia Racing Team Gresini Aprilia1'32.12111 J・ミルTeam SUZUKI ECSTARSuzuki1'32.42612 E・バスティアニーニ Esponsorama RacingDucati1'32.46113 中上貴晶 LCR Honda IDEMITSUHonda1'32.21014 M・ピロDucati Lenovo TeamDucati1'32.28715 L・マリーニ SKY VR46 EsponsoramaDucati1'32.28916 F・モルビデリ Monster Energy Yamaha MotoGPYamaha1'32.29617 B・ビンダーRed Bull KTM Factory RacingKTM1'32.42718 S・ブラドル Repsol Honda TeamHonda1'32.43919A・マルケス LCR Honda CASTROLHonda1'32.47620I・レクオーナ Tech 3 KTM Factory RacingKTM1'32.48121M・オリベイラ Red Bull KTM Factory RacingKTM1'32.82122 D・ペトルッチ Tech 3 KTM Factory RacingKTM1'32.89123V・ロッシ Petronas Yamaha SRTYamaha1'32.96724A・ドビツィオーゾPetronas Yamaha SRTYamaha1'33.098